La principal diferencia es que el material activo es diferente. El material activo de la batería secundaria es reversible, mientras que el material activo de la batería primaria no lo es. La autodescarga de la batería primaria es mucho menor que la de la batería secundaria. Pero la resistencia interna es mucho mayor que la de la batería secundaria, por lo que la capacidad de carga es menor. Además, la capacidad específica de masa y la capacidad específica de volumen de la batería principal son mayores que las de las baterías recargables generales.